MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

Total Repeats: 9626

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_002944	CGT	3	9	444420	444428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_002944	CCG	2	6	444461	444466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1003	NC_002944	CGC	3	9	444468	444476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1004	NC_002944	GCGG	2	8	444477	444484	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1005	NC_002944	CGG	2	6	445557	445562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_002944	CGC	2	6	445600	445605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1007	NC_002944	CCG	2	6	445606	445611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1008	NC_002944	CGC	2	6	445649	445654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1009	NC_002944	TCGG	2	8	448139	448146	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1010	NC_002944	AGA	2	6	448223	448228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_002944	C	6	6	448472	448477	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1012	NC_002944	G	6	6	448505	448510	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_002944	GC	3	6	448575	448580	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1014	NC_002944	CGC	2	6	449255	449260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1015	NC_002944	CCG	2	6	449266	449271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1016	NC_002944	TTC	2	6	449376	449381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_002944	GGT	2	6	449387	449392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_002944	G	6	6	449399	449404	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_002944	CGG	2	6	453897	453902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_002944	CGG	2	6	453908	453913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_002944	TGG	2	6	453939	453944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_002944	GCC	2	6	455218	455223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1023	NC_002944	CGG	3	9	456744	456752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_002944	CGG	2	6	461877	461882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_002944	GCG	2	6	461905	461910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_002944	AGGC	2	8	463520	463527	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1027	NC_002944	CGG	2	6	463559	463564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_002944	GCC	2	6	467016	467021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1029	NC_002944	CGCC	2	8	467032	467039	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1030	NC_002944	GCC	2	6	468435	468440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1031	NC_002944	GCG	2	6	468441	468446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_002944	GTG	2	6	468477	468482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_002944	CCG	3	9	468483	468491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1034	NC_002944	GC	4	8	468510	468517	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1035	NC_002944	AT	3	6	468533	468538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1037	NC_002944	GAG	2	6	468724	468729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_002944	CGG	2	6	470308	470313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_002944	GCC	2	6	475648	475653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1040	NC_002944	CCG	2	6	475683	475688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1041	NC_002944	CGC	2	6	475742	475747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1042	NC_002944	ACG	2	6	475753	475758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1044	NC_002944	CGC	2	6	475800	475805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1045	NC_002944	GAT	2	6	475869	475874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1049	NC_002944	CGA	4	12	480185	480196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_002944	GAG	2	6	480219	480224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_002944	CGCGG	2	10	481268	481277	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1052	NC_002944	GAAC	2	8	482817	482824	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1053	NC_002944	GTC	2	6	482839	482844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1055	NC_002944	CGC	2	6	487492	487497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1057	NC_002944	TGC	2	6	487536	487541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_002944	CGG	2	6	488032	488037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_002944	TTC	2	6	488072	488077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1061	NC_002944	ACG	2	6	488126	488131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_002944	GGC	2	6	488154	488159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_002944	CCG	2	6	488172	488177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1064	NC_002944	ACC	2	6	488291	488296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1068	NC_002944	CGC	2	6	492580	492585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1069	NC_002944	CGACC	2	10	492653	492662	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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1071	NC_002944	GTC	2	6	492716	492721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1079	NC_002944	CAGC	2	8	498272	498279	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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1082	NC_002944	CCGCG	2	10	501706	501715	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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1089	NC_002944	CG	3	6	504261	504266	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1096	NC_002944	GCCGC	2	10	509007	509016	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1097	NC_002944	CCCG	2	8	509054	509061	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1098	NC_002944	CG	3	6	509060	509065	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1099	NC_002944	C	6	6	509067	509072	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1100	NC_002944	CGC	2	6	509086	509091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1101	NC_002944	CCG	2	6	519224	519229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1102	NC_002944	TGC	3	9	519244	519252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_002944	GC	3	6	519322	519327	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1104	NC_002944	TCCC	2	8	524772	524779	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1105	NC_002944	CCG	2	6	524817	524822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1106	NC_002944	TGG	2	6	528536	528541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_002944	ACC	2	6	533620	533625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1108	NC_002944	GCC	2	6	533628	533633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1109	NC_002944	CGA	2	6	533654	533659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_002944	ACCG	2	8	533665	533672	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1111	NC_002944	CTC	2	6	534987	534992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1112	NC_002944	CAAG	2	8	537013	537020	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1113	NC_002944	TCG	2	6	538909	538914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_002944	AGA	2	6	540327	540332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_002944	CG	3	6	540375	540380	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1116	NC_002944	GAG	3	9	541488	541496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_002944	AAT	2	6	541501	541506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_002944	AAGC	2	8	543915	543922	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1119	NC_002944	CTTG	2	8	543924	543931	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1120	NC_002944	CGC	2	6	545707	545712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1121	NC_002944	CACC	2	8	545721	545728	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1122	NC_002944	CCG	2	6	545738	545743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1123	NC_002944	TTC	2	6	545745	545750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_002944	CGA	2	6	545767	545772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1126	NC_002944	CGA	2	6	554073	554078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1128	NC_002944	GGC	2	6	557575	557580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_002944	GAG	2	6	557605	557610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_002944	GC	3	6	560480	560485	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1131	NC_002944	TCG	2	6	560803	560808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_002944	CG	3	6	560807	560812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1133	NC_002944	CG	3	6	560826	560831	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1134	NC_002944	GAC	2	6	565393	565398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_002944	TCGA	2	8	565418	565425	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1136	NC_002944	GCCA	2	8	565470	565477	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1137	NC_002944	GATC	2	8	565506	565513	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1138	NC_002944	GCCT	2	8	565624	565631	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1139	NC_002944	CGG	2	6	565649	565654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1142	NC_002944	CGA	3	9	571072	571080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1151	NC_002944	GTG	2	6	579919	579924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1177	NC_002944	CGGC	2	8	595643	595650	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1400	NC_002944	ACGAGA	2	12	714048	714059	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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1402	NC_002944	GGCG	2	8	722432	722439	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1403	NC_002944	GGC	2	6	723271	723276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1405	NC_002944	GT	3	6	724945	724950	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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